ミミズ、ダンゴムシやトビムシなどは土壌の中で生息している動物は、土壌動物と呼ばれている。土壌動物は、土壌中に含まれている粗大有機物の破砕したり、土壌を攪拌したりして、土壌生成と肥沃度の向上に貢献している。例えば、ミミズは、植物遺体と土壌を同時に摂食し、破砕し、鉱物粒子と混合し糞塊とよばれる粒子を地中や地表に排出して、土壌肥沃度の向上に貢献している。